RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 NOS2P35228 1153 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNFP41002 786 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MATKP42679 507 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINB4P48594 390 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ2P63252 427 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 COG7P83436 770 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR17Q13304 367 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA5AQ13591 1074 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 VEPH1Q14D04 833 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PDGFRLQ15198 375 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB6Q15916 424 aa7.12□□□□□ -1.27
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SMARCE1-201ENST00000264640 INSCQ1MX18 579 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC157Q569K6 752 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 XKR4Q5GH76 650 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CGB2Q6NT52 195 aa7.12□□□□□ -1.27
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SMARCE1-201ENST00000264640 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PQLC3Q8N755 202 aa7.12□□□□□ -1.27
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SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MZB1Q8WU39 189 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC17Q96AE7 1141 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 C7orf26Q96N11 449 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA13Q96N96 652 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CLMPQ9H6B4 373 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 EBF2Q9HAK2 575 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TDP1Q9NUW8 608 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.12□□□□□ -1.27
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SMARCE1-201ENST00000264640 MID2Q9UJV3 735 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CHKBQ9Y259 395 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PLLPQ9Y342 182 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB3Q9Y575 518 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0G2JND7 137 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMARCE1-201ENST00000264640 OR6C75A6NL08 312 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMARCE1-201ENST00000264640 PIRO00625 290 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GLRA3O75311 464 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GJB3O75712 270 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CIB2O75838 187 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ANP32DO95626 131 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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SMARCE1-201ENST00000264640 MX2P20592 715 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINB6P35237 376 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXD12P35452 270 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 OPRD1P41143 372 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 LHX1P48742 406 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SULT1E1P49888 294 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HDAC4P56524 1084 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TMPRSS15P98073 1019 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CFHR1Q03591 330 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF33AQ06730 810 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MGAT5Q09328 741 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MESP2Q0VG99 397 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 E2F5Q15329 346 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF5Q15542 800 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 EML3Q32P44 896 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.11□□□□□ -1.27
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