RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SPAG17Q6Q759 2223 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 UPK3BL1B0FP48 263 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SOCS5O75159 536 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CA5AP35218 305 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CSNK1DP48730 415 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 NEK3P51956 506 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PTSQ03393 145 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CDH17Q12864 832 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 HIF1AQ16665 826 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 Q6ZVL8 140 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 DSG4Q86SJ6 1040 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 C1orf210Q8IVY1 113 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SEC14L1Q92503 715 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SCRN2Q96FV2 425 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 FEM1CQ96JP0 617 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 IGLON5A6NGN9 336 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 H0Y8X5 98 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 K7ESM1 405 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 NPC1O15118 1278 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 C5AR1P21730 350 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 BCKDHBP21953 392 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 NMBRP28336 390 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ELK3P41970 407 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LIG3P49916 1009 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ARSDP51689 593 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 RALGDSQ12967 914 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 MORF4L2Q15014 288 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TCEA2Q15560 299 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CNGA3Q16281 694 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 BRAT1Q6PJG6 821 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 FBXL6Q8N531 539 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CFAP36Q96G28 342 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GPR174Q9BXC1 333 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 EBF2Q9HAK2 575 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PLAC1Q9HBJ0 212 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CASS4Q9NQ75 786 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 WHRNQ9P202 907 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SLC31A1O15431 190 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LAMTOR5O43504 91 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ATG13O75143 517 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SUN1O94901 812 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TPSB2P20231 275 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 AVPR2P30518 371 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SSTR1P30872 391 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 MMP12P39900 470 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 MAPK8P45983 427 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 FGL2Q14314 439 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TPSAB1Q15661 275 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PLPP6Q8IY26 295 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CCHCR1Q8TD31 782 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SNX19Q92543 992 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PPP1R16AQ96I34 528 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 FMO2Q99518 471 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GPR63Q9BZJ6 419 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 HAUS2Q9NVX0 235 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ZNF711Q9Y462 761 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CAPN8A6NHC0 703 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SCAMP1O15126 338 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LDB2O43679 373 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ADH1BP00325 375 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ELFN1P0C7U0 828 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GM2AP17900 193 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CDKN3Q16667 212 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms