RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PID1Q7Z2X4 250 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 FCRL5Q96RD9 977 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GTQ1 180 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 USP27XA6NNY8 438 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CER1O95813 267 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ELFN1P0C7U0 828 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.172e-7■□□□□ 10.3
SYF2-201ENST00000236273 IRF4Q15306 451 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 KDELC1Q6UW63 502 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PIP4P1Q86T03 277 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PELI3Q8N2H9 469 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PAF1Q8N7H5 531 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TTC13Q8NBP0 860 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SKA1Q96BD8 255 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 LYSMD1Q96S90 227 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 UBP1Q9NZI7 540 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 A6NNZ2 444 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 FPGTO14772 594 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PTSQ03393 145 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SLC14A1Q13336 389 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 LRRC14Q15048 493 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 GDF3Q9NR23 364 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 KCNN4O15554 427 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN12O43309 604 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 MAGEC1O60732 1142 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 RXRGP48443 463 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CDK18Q07002 472 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 USP45Q70EL2 814 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CAPN8A6NHC0 703 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 F5H423 210 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ENC1O14682 589 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CA4P22748 312 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 RABIFP47224 123 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 GDF10P55107 478 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 FZD2Q14332 565 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 GALNT3Q14435 633 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 LRRC66Q68CR7 880 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 EID2BQ96D98 161 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 C5orf60A6NFR6 353 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PSMD11O00231 422 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 DFNA5O60443 496 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PMPCBO75439 489 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 C1SP09871 688 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CXCR5P32302 372 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ETV3P41162 512 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 EPHB1P54762 984 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 WNT3AP56704 352 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 IL9RQ01113 521 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 BNIP3Q12983 259 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 INPP5AQ14642 412 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ACOX1Q15067 660 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PCSK7Q16549 785 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZVL8 140 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms