RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PLK4O00444 970 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KLRC4O43908 158 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ATG13O75143 517 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BMP7P18075 431 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HDCP19113 662 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EPORP19235 508 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TFEBP19484 476 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GLUD2P49448 558 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCR4P51679 360 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RPL38P63173 70 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.23□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.23□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SNX15Q9NRS6 342 aa7.23□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SPATA2Q9UM82 520 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OR10H1Q9Y4A9 318 aa7.23□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MEIS2O14770 477 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SUV39H1O43463 412 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SNX3O60493 162 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TSC22D2O75157 780 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DNTTP04053 509 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MC4RP32245 332 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DLG4P78352 724 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RGS21Q2M5E4 152 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PIGZQ86VD9 579 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GBA3Q9H227 469 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CALML5Q9NZT1 146 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SSR3Q9UNL2 185 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TRIM17Q9Y577 477 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLIT2O94813 1529 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KCNK1O00180 336 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AREL1O15033 823 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 CCNCP24863 283 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ABL2P42684 1182 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PLK1P53350 603 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PUDPQ08623 228 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PRKG2Q13237 762 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZACNQ401N2 412 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MTX3Q5HYI7 312 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FBXO30Q8TB52 745 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LINGO1Q96FE5 620 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RHOJQ9H4E5 214 aa7.23□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 DMTF1Q9Y222 760 aa7.23□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A3O75751 556 aa7.22□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 MMP3P08254 477 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ATP12AP54707 1039 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PRMT2P55345 433 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CNTN2Q02246 1040 aa7.22□□□□□ -1.25
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CPS1-201ENST00000233072 NOMO1Q15155 1222 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KAT5Q92993 513 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SEMA3CQ99985 751 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ABCC6O95255 1503 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MRC1P22897 1456 aa7.22□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.22□□□□□ -1.25
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