RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klc2O88448 599 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pde8aO88502 823 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itga7Q61738 1179 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exoc3l1Q8BI71 739 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nrif1Q923B3 828 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubox5Q925F4 539 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pi16Q9ET66 489 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc29a1Q9JIM1 460 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 EcsitQ9QZH6 435 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plce1Q8K4S1 2282 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nxpe3B9EKK6 559 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8108K7N734 216 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 ChrngP04760 519 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adh5P28474 374 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col6a2Q02788 1034 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 CblbQ3TTA7 982 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem164Q6PHN7 296 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ssxb5Q6XAS2 159 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Morc4Q8BMD7 928 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 CtsrQ9JIA9 334 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plxna3P70208 1872 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plxna4Q80UG2 1893 aa11.81□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam155bA2BDP1 471 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10718D3Z1I7 227 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinb6eI7HJI3 429 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm6408J3QNG1 320 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3402K7N5P2 326 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 CtssO70370 340 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pfdn6Q03958 127 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgap2Q3TQR0 254 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taar7aQ5QD12 358 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 HadhQ61425 314 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem259Q8CIV2 574 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tram1l1Q8QZR0 363 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 DdoQ922Z0 341 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atad3Q925I1 591 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grk2Q99MK8 689 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrfap1Q9CQL7 125 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc17Q9CXD9 443 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Actl7aQ9QY84 440 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttll9A2APC3 461 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gbp11A9YVJ5 442 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnldc1B2RXZ1 531 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tsga10ipF7A1F0 157 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ltb4rO88855 351 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01670 111 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01671 111 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01672 111 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bcl6P41183 707 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msh2P43247 935 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp791Q497V9 528 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc8bQ5DU41 803 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 StyxQ60969 223 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf1cQ6PDZ2 836 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxo9Q8BK06 437 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 OlahQ8R197 265 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plpp3Q99JY8 312 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il20Q9JKV9 176 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm13283A0A087WPG5 182 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smok3aC0HKC8 504 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smok3bC0HKC9 504 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Catsperg2C6KI89 1145 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3183D3YUJ6 481 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glyatl3E9Q5L8 290 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3139J3QK78 481 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3106J3QPH3 481 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r10K7N621 847 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 NcstnP57716 708 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxw18Q3TSA9 469 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grid1Q61627 1009 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam107aQ78TU8 144 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zic5Q7TQ40 622 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pggt1bQ8BUY9 377 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr74Q8VCG3 384 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc14Q921R4 703 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 CtsmQ9JL96 333 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grm3Q9QYS2 879 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtm1Q9Z2C5 603 aa11.8□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klhl32A2AJX0 620 aa11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm4847G3X946 537 aa11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Capn2O08529 700 aa11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 DldO08749 509 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces1cP23953 554 aa11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bcl2a1cQ0P538 128 aa11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfyve1Q810J8 777 aa11.79□□□□□ -0.52
Herc3-201ENSMUST00000031823 Btbd9Q8C726 612 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms