RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Galnt10Q6P9S7 603 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arl5aQ80ZU0 179 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smarcal1Q8BJL0 910 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fmo9Q8C116 539 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr589Q8VGV8 317 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem114Q9D563 222 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PgcQ9D7R7 392 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NckipsdQ9ESJ4 714 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prl5a1Q9JII2 230 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MgamB5THE2 1827 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Col4a6B1AVK5 1691 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cilp2D3Z7H8 1162 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il13ra1O09030 424 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Man1a1P45700 655 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 E2f2P56931 443 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IqcmQ149I8 489 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc160Q3UYG1 323 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B3gnt3Q5JCS9 372 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp606Q7TSV0 794 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mppe1Q80XL7 396 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ToporsQ80Z37 1033 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem198Q8BG75 360 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf208Q8K0W3 265 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Emid1Q91VF5 444 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TrabdQ99JY4 376 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pin4Q9CWW6 131 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Paip2Q9D6V8 124 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P2yr13Q9D8I2 337 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chrnb2Q9ERK7 501 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B9d1Q9R1S0 204 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa10.27□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm14401A2ARV7 303 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm20509G3UZF1 325 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp275G3X904 499 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kbtbd2G3X9X1 623 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PargO88622 969 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01648 108 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MaptP10637 733 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gna12P27600 379 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gsta3P30115 221 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Polr3bP59470 1133 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps24P62849 133 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnajb14Q149L6 379 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 UcmaQ14BU0 138 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp956Q3UZY6 572 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vwa2Q70UZ7 791 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DcstampQ7TNJ0 470 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B3gnt5Q8BGY6 376 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppm1lQ8BHN0 360 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DseQ8BLI4 958 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Glis1Q8K1M4 789 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mta1Q8K4B0 715 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atg10Q8R1P4 215 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adcy4Q91WF3 1077 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 KmoQ91WN4 479 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhga10Q91XY9 930 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fndc8Q9D2H8 321 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ifrd2Q9D8U0 441 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Actrt1Q9D9J3 376 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Isca2Q9DCB8 154 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DgkeQ9R1C6 564 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3604A0A087WPN2 559 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dthd1E9PZX1 795 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atn1O35126 1175 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd151O35566 253 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prkag1O54950 330 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LtfP08071 707 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smpdl3bP58242 456 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc127Q3TC33 260 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slfn4Q3UV66 602 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akap14Q3V0I7 536 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Brsk1Q5RJI5 778 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GpamQ61586 827 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp4aQ64436 1033 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc39a14Q75N73 489 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chil6Q80W26 440 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam72aQ8BFZ8 149 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem169Q8BG50 297 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PigwQ8C398 503 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp45Q8K387 813 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prkag2Q91WG5 566 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DcxrQ91X52 244 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc30a1Q99J38 664 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim8Q99PJ2 551 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prorsd1Q9D820 169 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpc1Q9QZF2 557 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RecqlQ9Z129 648 aa10.26□□□□□ -0.77
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.5 ms