RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 LINGO4Q6UY18 593 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 PACS1Q6VY07 963 aa16.88■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPRN2Q92932 1015 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 22.9
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC7A4O43246 635 aa16.87■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.87■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa16.87■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM155BO75949 473 aa16.86■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 STARD6P59095 220 aa16.86■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CHKBQ9Y259 395 aa16.86■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SIT1Q9Y3P8 196 aa16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CHRNA4P43681 627 aa16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 MBLAC2Q68D91 279 aa16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.85■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.85■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.85■□□□□ 0.29
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TRAPPC3-210ENST00000617904 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 PKP3Q9Y446 797 aa16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 MROH6A6NGR9 719 aa16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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