RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	CDC25C	P30307	473 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	PER3	P56645	1201 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ASIC1	P78348	528 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	E2F1	Q01094	437 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	REST	Q13127	1097 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF77	Q15935	545 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	MANEA	Q5SRI9	462 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF280D	Q6N043	979 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	IQCA1	Q86XH1	822 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	STKLD1	Q8NE28	680 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ATL2	Q8NHH9	583 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ESR2	Q92731	530 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	GPATCH3	Q96I76	525 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	TEX101	Q9BY14	249 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	KCND3	Q9UK17	655 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ACAN	P16112	2415 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	TRIP11	Q15643	1979 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	MYMK	A6NI61	221 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	CHMP2A	O43633	222 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	FGA	P02671	866 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	THEGL	P0DJG4	465 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	HKR1	P10072	659 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	CD99	P14209	185 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ACP1	P24666	158 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	NTSR1	P30989	418 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	C21orf59	P57076	290 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	KLRB1	Q12918	225 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	MTM1	Q13496	603 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ARL14	Q8N4G2	192 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	RNF149	Q8NC42	400 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	COG1	Q8WTW3	980 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	HPS3	Q969F9	1004 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM143	Q96AN5	459 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC51	Q96ER9	411 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	SLC22A12	Q96S37	553 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FAM86B1	E9PN63	330 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CDKL5	O76039	1030 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ATF6	P18850	670 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TAF12	Q16514	161 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	UPP1	Q16831	310 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ISX	Q2M1V0	245 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	MED25	Q71SY5	747 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	C14orf80	Q86SX3	495 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ITIH5	Q86UX2	942 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CHPF	Q8IZ52	775 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TEX19	Q8NA77	164 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		5.15	□□□□□ -1.59

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