RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 USE1Q9NZ43 259 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 COPG2Q9UBF2 871 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FZD10Q9ULW2 581 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MATN3O15232 486 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HS6ST1O60243 411 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP7B1O75881 506 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FTH1P02794 183 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 IMPDH2P12268 514 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 GNA12Q03113 381 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ABRQ12979 859 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO30Q8TB52 745 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TEPSINQ96N21 525 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNH1O95259 989 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPAP49450 140 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NAA20P61599 178 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNL1Q8IU54 200 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CHPFQ8IZ52 775 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF839A8K0R7 811 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 QSOX1O00391 747 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CCL22O00626 93 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00032P0C843 101 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ACLYP53396 1101 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC157Q569K6 752 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PPEF2O14830 753 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ATG7O95352 703 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 IL1R2P27930 398 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FSTL1Q12841 308 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 GRM3Q14832 879 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ATAD3BQ5T9A4 648 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TRMOQ9BU70 441 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NXNL1Q96CM4 212 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MSRAQ9UJ68 235 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT36O76013 467 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 UGT2B4P06133 528 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FGFR3P22607 806 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NRF1Q16656 503 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MPSTP25325 297 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MPPE1Q53F39 396 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CUZD1Q86UP6 607 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSS2Q9NR19 701 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1B0GVM2 712 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS5O15539 181 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 DPYSL2Q16555 572 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TCF4P15884 667 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LIMK2P53671 638 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MPP1Q00013 466 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HMCESQ96FZ2 354 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM63AO94886 807 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PIK3R1P27986 724 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 GLMNQ92990 594 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TULP2O00295 520 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms