RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 LINGO4Q6UY18 593 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RTP4Q96DX8 246 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 HDAC8Q9BY41 377 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DUSP16Q9BY84 665 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RRN3Q9NYV6 651 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 B4E171 279 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 BIN1O00499 593 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PPP6R2O75170 966 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DLGAP3O95886 979 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 FAM107AO95990 144 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ALPIP09923 528 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF18P17022 549 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 IGFALSP35858 605 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NNMTP40261 264 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TSPAN7P41732 249 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ASPAP45381 313 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ME1P48163 572 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CYP24A1Q07973 514 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.528e-7■■□□□ 11.9
HCG18-241ENST00000602290 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ANKS6Q68DC2 871 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TMEM135Q86UB9 458 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SFTPA2Q8IWL1 248 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CAVIN3Q969G5 261 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 AZIN2Q96A70 460 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 C19orf60Q96EN9 201 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 C8orf76Q96K31 380 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CCDC114Q96M63 670 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 USP28Q96RU2 1077 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 LUZP4Q9P127 313 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 COL6A5A8TX70 2615 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 JMJD1CQ15652 2540 aa11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF202O95125 648 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NUMBP49757 651 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 HK3P52790 923 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RAB15P59190 212 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SULT2A1Q06520 285 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ALCAMQ13740 583 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TRIM14Q14142 442 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MS4A13Q5J8X5 152 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NAA35Q5VZE5 725 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MSANTD2Q6P1R3 559 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CNGA4Q8IV77 575 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 AGBL5Q8NDL9 886 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SPDL1Q96EA4 605 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MDFIQ99750 246 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.8□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms