RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP58Q5T655 872 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 APPL1Q9UKG1 709 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CYSRT1A8MQ03 144 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF11O60813 436 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 NFATC3Q12968 1075 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CERCAMQ5T4B2 595 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 OGFOD3Q6PK18 319 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 OR56A4Q8NGH8 313 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRK1Q38SD2 2015 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 NVLO15381 856 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPCP11150 499 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 GLB1P16278 677 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 AIF1P55008 147 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1024LP59773 190 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 USP53Q70EK8 1073 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRED1Q7Z699 444 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF8Q7Z7C8 310 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM46DQ8NEK8 389 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SGF29Q96ES7 293 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF215Q9Y6U7 377 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF10O60809 474 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ETV5P41161 510 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TPI1P60174 286 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 OGDHQ02218 1023 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNC4Q03721 635 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL4L1Q8NHW4 92 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CNPY3Q9BT09 278 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A8Q9C0K1 460 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM168Q9H0V1 697 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-211ENST00000590874 B4DGG1 531 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 WISP1O95388 367 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 GM2AP17900 193 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 NDST2P52849 883 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf28Q4W4Y0 310 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPIQ6XZB0 460 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SRLQ86TD4 932 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 EXTL1Q92935 676 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ECHDC3Q96DC8 303 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXJ2Q9P0K8 574 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 LRIT1Q9P2V4 623 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP69A5D8W1 941 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD62A6NC57 917 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PNLIPP16233 465 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA4P29622 427 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK1DP48730 415 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCP1Q15431 976 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 VASH2Q86V25 355 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFAND4Q86XD8 727 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SLITRK4Q8IW52 837 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PELI3Q8N2H9 469 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 LGR4Q9BXB1 951 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 DPEP2Q9H4A9 486 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PALMO75781 387 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ELFN1P0C7U0 828 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CA9Q16790 459 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 USP7Q93009 1102 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM159Q96B96 161 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 NSMCE3Q96MG7 304 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 AGPAT1Q99943 283 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4F12Q9HCS2 524 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf172C9J069 976 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF10CO14798 259 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB2P05107 769 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 TPM2P07951 284 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 WT1P19544 449 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 KELP23276 732 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR7P34969 479 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM23P36406 574 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 AFMIDQ63HM1 303 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 DPPA4Q7L190 304 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CMKLR1Q99788 373 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM4Q9C037 500 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM117AQ9C073 453 aa25.73■■□□□ 1.71
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