RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 RAB21Q9UL25 225 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CA14Q9ULX7 337 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SCML1Q9UN30 329 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ESYT3A0FGR9 886 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TSPAN11A1L157 253 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 MAGEB16A2A368 324 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 HEATR9A2RTY3 570 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SDR42E2A6NKP2 422 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM170BA6NMN3 283 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC7A4O43246 635 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 DCXO43602 365 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 BNIP3LO60238 219 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SIN3BO75182 1162 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SPAG6O75602 509 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 LEFTY1O75610 366 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ALDH1A2O94788 518 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM63AO94886 807 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PGLSO95336 258 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TTC4O95801 387 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CPP00450 1065 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 UGT2B4P06133 528 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 MMP2P08253 660 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 GSTA2P09210 222 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CHRNB1P11230 501 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 HOXB2P14652 356 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TSHRP16473 764 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PRKCHP24723 683 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ITGB7P26010 798 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ADRA1AP35348 466 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RPS9P46781 194 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RGRP47804 291 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 NUMBP49757 651 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 DGKEP52429 567 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SEC13P55735 322 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 VSNL1P62760 191 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ZXDAP98168 799 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ELP6Q0PNE2 266 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 MESP2Q0VG99 397 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TRAF2Q12933 501 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC1A5Q15758 541 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PCSK7Q16549 785 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 C2orf27AQ580R0 203 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF805Q5CZA5 627 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 C9orf64Q5T6V5 341 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ERAP2Q6P179 960 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RANBP10Q6VN20 620 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 GDPD4Q6W3E5 623 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 KBTBD6Q86V97 674 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RELL1Q8IUW5 271 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SIX5Q8N196 739 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PJA1Q8NG27 643 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PTPRN2Q92932 1015 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RAB7BQ96AH8 199 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 RMDN1Q96DB5 314 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 SERPINB12Q96P63 405 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 C19orf43Q9BQ61 176 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 FICDQ9BVA6 458 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 IL22Q9GZX6 179 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CHRDQ9H2X0 955 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 MFSD1Q9H3U5 465 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 CASS4Q9NQ75 786 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-213ENST00000589475 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms