RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587256.1

ATG4D-207, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-207ENST00000587256 PCCBP05166 539 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TGM2P21980 687 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CES1P23141 567 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PMLP29590 882 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 BNIP3Q12983 259 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ZBTB17Q13105 803 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ACOX1Q15067 660 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 USP45Q70EL2 814 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 EXD1Q8NHP7 514 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 SPOCK2Q92563 424 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CEP41Q9BYV8 373 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 GPR27Q9NS67 375 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CCDC66A2RUB6 948 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CFAP69A5D8W1 941 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 H3BM21 787 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 VIPR1P32241 457 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 NR2C2P49116 596 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 EPHB1P54762 984 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PFN3P60673 137 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PTK2BQ14289 1009 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 FZD2Q14332 565 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TAZQ16635 292 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CCDC181Q5TID7 509 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 DENND2CQ68D51 928 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 LIPIQ6XZB0 460 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 EID2Q8N6I1 236 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 P3H4Q92791 437 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 HAUS1Q96CS2 278 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TOR1BO14657 336 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 FFAR2O15552 330 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TNFSF14O43557 240 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TRIM16O95361 564 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CTPS1P17812 591 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CD86P42081 329 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 YPEL5P62699 121 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ARHGEF7Q14155 803 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CNGA3Q16281 694 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PPP2R5EQ16537 467 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 HS1BP3Q53T59 392 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CCDC157Q569K6 752 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 MACC1Q6ZN28 852 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 GLRX5Q86SX6 157 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 NUS1Q96E22 293 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 IFT43Q96FT9 208 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 AGAP3Q96P47 875 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 IL12RB2Q99665 862 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PIAS2O75928 621 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CSF2P04141 144 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 PDHA1P08559 390 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ALPIP09923 528 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 LHCGRP22888 699 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 DGKAP23743 735 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CTNNA2P26232 953 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 HTR1BP28222 390 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 CETN2P41208 172 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 RWDD2BP57060 319 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 COPS2P61201 443 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 ADCY2Q08462 1091 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 MTM1Q13496 603 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4D-207ENST00000587256 AGERQ15109 404 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms