RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NSMCE1Q8WV22 266 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BOCQ9BWV1 1114 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ELFN1P0C7U0 828 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TSHRP16473 764 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HTR1BP28222 390 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HK3P52790 923 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C1orf61Q13536 156 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DPYSL3Q14195 570 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MARC1Q5VT66 337 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IFI44Q8TCB0 444 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CLPBQ9H078 707 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NOD2Q9HC29 1040 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCUBE2Q9NQ36 999 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR1A2Q9Y585 309 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 YY2O15391 372 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCCBP05166 539 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GM2AP17900 193 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MMP13P45452 471 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ALG11Q2TAA5 492 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TEX26Q8N6G2 289 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PLA2G15Q8NCC3 412 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATL2Q8NHH9 583 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF670Q9BS34 389 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TSPY26PQ9H489 355 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LHX6Q9UPM6 363 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRRK1Q38SD2 2015 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ITPR1Q14643 2758 aa24.2■■□□□ 1.47
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RASGRP1O95267 797 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ANXA6P08133 673 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PDK2Q15119 407 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NR0B2Q15466 257 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CDKN3Q16667 212 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HID1Q8IV36 788 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 VSTM4Q8IW00 320 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCTD6Q8NC69 237 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GLMNQ92990 594 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WDR92Q96MX6 357 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABCG4Q9H172 646 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DEF6Q9H4E7 631 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 B4GALT6Q9UBX8 382 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AK5Q9Y6K8 562 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MFSD11O43934 449 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CPP00450 1065 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM253P0C7T8 217 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAN1A1P33908 653 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RPIAP49247 311 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TAS2R40P59535 323 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KIAA1024LP59773 190 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAXP61244 160 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GALNT2Q10471 571 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRAF2Q12933 501 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ELOCQ15369 112 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GUSBP11Q6P575 273 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAP7D3Q8IWC1 876 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DEPDC7Q96QD5 511 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KLQ9UEF7 1012 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 APC2O95996 2303 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ANKRD36A6QL64 1941 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 A0A087WV48 116 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CPED1A4D0V7 1026 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 A8MX80 341 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AKR1B10O60218 316 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KRT7P08729 469 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TPM1P09493 284 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ALPIP09923 528 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NFKBIAP25963 317 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GJC1P36383 396 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRIM23P36406 574 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SRP54P61011 504 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C19orf48Q6RUI8 117 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms