RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 MFAP3LO75121 409 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PCCBP05166 539 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 KRT7P08729 469 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM253P0C7T8 217 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 CR2P20023 1033 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 IL4RP24394 825 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 HTR1BP28222 390 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 MMP13P45452 471 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 BLKP51451 505 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ARSEP51690 589 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 MTM1Q13496 603 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 DPYSL3Q14195 570 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NFATC4Q14934 902 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PDK2Q15119 407 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 MARC1Q5VT66 337 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PGBD5Q8N414 524 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 KCTD6Q8NC69 237 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ATL2Q8NHH9 583 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 SPOCK2Q92563 424 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF670Q9BS34 389 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 APOOQ9BUR5 198 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 LRRC61Q9BV99 259 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 LMO7DNF2Z398 122 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 CPP00450 1065 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 GP1BAP07359 652 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ANXA6P08133 673 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 MYF5P13349 255 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NFKBIAP25963 317 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 MAN1A1P33908 653 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 TAS2R40P59535 323 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 MAXP61244 160 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf61Q13536 156 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 INPP5AQ14642 412 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 LIPIQ6XZB0 460 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 HID1Q8IV36 788 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 GLMNQ92990 594 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC42Q96M95 316 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NOD2Q9HC29 1040 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 RAXQ9Y2V3 346 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 OR1A2Q9Y585 309 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 U3KQA8 63 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 A8MX80 341 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 OPA1O60313 960 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 GCATO75600 419 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 RASGRP1O95267 797 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 MT-CO3P00414 261 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 VIPR1P32241 457 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 RPIAP49247 311 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 HK3P52790 923 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 GALNT2Q10471 571 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 TRAF2Q12933 501 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ACOX1Q15067 660 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NR0B2Q15466 257 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ALG11Q2TAA5 492 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 CNGA4Q8IV77 575 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 SPC24Q8NBT2 197 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 IFI44Q8TCB0 444 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 WDR92Q96MX6 357 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 CHP1Q99653 195 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 NT5MQ9NPB1 228 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM3-215ENST00000568477 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms