RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TIMM23	O14925	209 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HSPA12A	O43301	675 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZIC3	O60481	467 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	F9	P00740	461 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RRM1	P23921	792 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ELF1	P32519	619 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAS1	P54826	345 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTP4A2	Q12974	167 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TXNDC8	Q6A555	127 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HAO1	Q9UJM8	370 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1B0GVC2	190 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLSCR5	A0PG75	271 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRSS44	E7EML9	344 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABCD3	P28288	659 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIGA	P37287	484 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CXCR3	P49682	368 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT24	Q2M2I5	525 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	AMZ1	Q400G9	498 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TDRP	Q86YL5	185 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGSF21	Q96ID5	467 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADGRG7	Q96K78	797 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SH3GL2	Q99962	352 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	NDST4	Q9H3R1	872 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR108	Q9NPR9	543 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		5	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	AGR2	O95994	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRC	P12931	536 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	AGA	P20933	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CASP6	P55212	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SORD	Q00796	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDR1	Q08345	913 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	MYBPH	Q13203	477 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCNG2	Q16589	344 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1W2PPH5	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAF4	O00268	1085 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLGN	O14967	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLK8	O60259	260 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEC14L2	O76054	403 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDA	P32320	146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUB	P50607	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	GRIK3	Q13003	919 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNTA1	Q13424	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms