RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SHC3	Q92529	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CD101	Q93033	1021 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	BBS2	Q9BXC9	721 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	COL4A2	P08572	1712 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		F8VZ95	297 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	EPHB6	O15197	1021 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KDM1A	O60341	852 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	STC2	O76061	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDH8	O95206	1070 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CAVIN2	O95810	425 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	EGF	P01133	1207 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ERBB2	P04626	1255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TPM1	P09493	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GLUL	P15104	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FER	P16591	822 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	AOC1	P19801	751 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	WAS	P42768	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NUMB	P49757	651 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MRE11	P49959	708 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF132	P52740	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CDK17	Q00537	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF5	Q15542	800 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PNKP	Q96T60	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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