RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TGFB1I1O43294 461 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFB5O43674 189 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 IFNGP01579 166 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ERCC2P18074 760 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TACR2P21452 398 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 IDSP22304 550 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 LRPAP1P30533 357 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PKNOX1P55347 436 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 XKR4Q5GH76 650 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 CHST7Q9NS84 486 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 DEC1Q9P2X7 70 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C3orf18Q9UK00 162 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 ITGA2BP08514 1039 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ALPPL2P10696 532 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CPA2P48052 419 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 FLT3LGP49771 235 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C2CD6Q53TS8 623 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 BHMTQ93088 406 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RTKNQ9BST9 563 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 GMIPQ9P107 970 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 GGT7Q9UJ14 662 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TEX28O15482 410 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC166P0CW27 439 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PBX1P40424 430 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 UGT2B15P54855 530 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF33AQ06730 810 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PRKG2Q13237 762 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TREML2Q5T2D2 321 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MFSD5Q6N075 450 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TTLQ8NG68 377 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RNFT2Q96EX2 444 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 S100A13Q99584 98 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CLOCKO15516 846 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MON1BQ7L1V2 547 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TDRPQ86YL5 185 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB2Q8N680 514 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 UBOX5O94941 541 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 UMPSP11172 480 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CMPK1P30085 196 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SSTR1P30872 391 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 FLT3P36888 993 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 JAM2P57087 298 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 STX4Q12846 297 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf64Q86WR6 236 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SNX32Q86XE0 403 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 COPS5Q92905 334 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 HAPLN3Q96S86 360 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SNX7Q9UNH6 387 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 VWA7Q9Y334 891 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 LTN1O94822 1766 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 MAP2K7O14733 419 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 MATN3O15232 486 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 HNMTP50135 292 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 BLKP51451 505 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TAF13Q15543 124 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GPR158Q5T848 1215 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 KRT74Q7RTS7 529 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.52□□□□□ -1.05
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