RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 LIASO43766 372 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 PMPCBO75439 489 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 TM7SF2O76062 418 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ALPIP09923 528 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ENGP17813 658 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CA4P22748 312 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CD38P28907 300 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 HNF1BP35680 557 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 EPHB1P54762 984 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GNG11P61952 73 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 STAT4Q14765 748 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 TEAD4Q15561 434 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 PCSK7Q16549 785 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 LIPIQ6XZB0 460 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ASB12Q8WXK4 309 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 PBKQ96KB5 322 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 PIEZO1Q92508 2521 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 A0A0U1RQS6 177 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ARHGAP33O14559 1287 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 C6P13671 934 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 AKT2P31751 481 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 VIPR1P32241 457 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GRIA4P48058 902 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CLDN2P57739 230 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 SNX1Q13596 522 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 MS4A14Q96JA4 679 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 BMFQ96LC9 184 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 TRIB3Q96RU7 358 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 A0A0J9YYE9 177 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CFAP69A5D8W1 941 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 C5orf60A6NFR6 353 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 VILLO15195 856 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 TRBC1P01850 177 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 SYPP08247 313 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GDF10P55107 478 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CDK18Q07002 472 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GRIK2Q13002 908 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 SLC14A2Q15849 920 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 QPCTQ16769 361 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 KIF19Q2TAC6 998 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 KDELC1Q6UW63 502 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CENPTQ96BT3 561 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 SPATA13Q96N96 652 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 WDR24Q96S15 920 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 KCND1Q9NSA2 647 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ZNF292O60281 2723 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 H0Y8X5 98 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ELFN1P0C7U0 828 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GM2AP17900 193 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 LHCGRP22888 699 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 NFKBIAP25963 317 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 WNT3AP56704 352 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GALNT3Q14435 633 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CNGA3Q16281 694 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CCNG2Q16589 344 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 USP45Q70EL2 814 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-216ENST00000550208 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms