RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB11FIP2Q7L804 512 aa24.17■■□□□ 1.46
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PTPRJ-205ENST00000527952 HCAR2Q8TDS4 363 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 NSMCE3Q96MG7 304 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 PEBP4Q96S96 227 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 D6RAR5 112 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRJ-205ENST00000527952 SLC5A2P31639 672 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRJ-205ENST00000527952 PELI3Q8N2H9 469 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
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PTPRJ-205ENST00000527952 DAPK3O43293 454 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPRJ-205ENST00000527952 GRM3Q14832 879 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPRJ-205ENST00000527952 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM7Q9C029 511 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM168Q9H0V1 697 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPRJ-205ENST00000527952 ERCC2P18074 760 aa24.14■■□□□ 1.45
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PTPRJ-205ENST00000527952 RNF215Q9Y6U7 377 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRJ-205ENST00000527952 NOBOXO60393 691 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP1A3P13637 1013 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-205ENST00000527952 DESP17661 470 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-205ENST00000527952 CSNK1DP48730 415 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-205ENST00000527952 RFX8Q6ZV50 586 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-205ENST00000527952 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.12■■□□□ 1.45
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