RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 LZTR1Q8N653 840 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NPWQ8N729 165 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PHC3Q8NDX5 983 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC6A18Q96N87 628 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 GFRA2O00451 464 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ADH1BP00325 375 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RETP07949 1114 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM153BP0C7A2 387 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 OXTRP30559 389 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC20A2Q08357 652 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PDK2Q15119 407 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SYT12Q8IV01 421 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF276Q8N554 614 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SHISA7A6NL88 538 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SNX2O60749 519 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TJP3O95049 919 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 IGLV3-25P01717 112 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SYPP08247 313 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ALPIP09923 528 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC1A1P43005 524 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 DPYSL3Q14195 570 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPRRQ15256 657 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFB124Q8NES8 71 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ACTL9Q8TC94 416 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC45Q96CN5 670 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF157Q96PX1 679 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SMIM14Q96QK8 99 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 GIPC1O14908 333 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NPC1O15118 1278 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 KDELR3O43731 214 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 OPHN1O60890 802 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 AKT2P31751 481 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 P2RY2P41231 377 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SPARCL1Q14515 664 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 ACAP1Q15027 740 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FXNQ16595 210 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 COG1Q8WTW3 980 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NINJ1Q92982 152 aa6.59□□□□□ -1.35
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RRN3P1-201ENST00000514813 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 NOD2Q9HC29 1040 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 TM7SF2O76062 418 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 THEGLP0DJG4 465 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ENGP17813 658 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 CA4P22748 312 aa6.58□□□□□ -1.36
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