RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 HAUS4Q9H6D7 363 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 RABGEF1Q9UJ41 708 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 CFAP69A5D8W1 941 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CDRT15L2A8MXV6 281 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 RNF8O76064 485 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TNFSF15O95150 251 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TNFP01375 233 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 FTLP02792 175 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 SKOR1P84550 965 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TYRO3Q06418 890 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 BCL2L1Q07817 233 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ASIC2Q16515 512 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CCDC183Q5T5S1 534 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 LIPIQ6XZB0 460 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TP53INP2Q8IXH6 220 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ARL14Q8N4G2 192 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 PAF1Q8N7H5 531 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ECHDC3Q96DC8 303 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 PDXPQ96GD0 296 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 DGKBQ9Y6T7 804 aa17.01■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CCDC187A0A096LP49 1063 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TMEM202A6NGA9 273 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 A8MX80 341 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ERVH48-1M5A8F1 160 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 SCNN1BP51168 640 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CCL7P80098 99 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 IL10RBQ08334 325 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ZNF843Q8N446 348 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 FNIP1Q8TF40 1166 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 OR1E3Q8WZA6 343 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 NSMCE3Q96MG7 304 aa17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQM1 296 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 LRCH4O75427 683 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ELFN1P0C7U0 828 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 GZMAP12544 262 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 HCAR3P49019 387 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 RHDQ02161 417 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CFHR1Q03591 330 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 VAC14Q08AM6 782 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ANO6Q4KMQ2 910 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 DPPA4Q7L190 304 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ZNF653Q96CK0 615 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 PSKH2Q96QS6 385 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 FGF22Q9HCT0 170 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 MYO1AQ9UBC5 1043 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 LRP4O75096 1905 aa16.99■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 D6RAR5 112 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 MBD3O95983 291 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ITGA2BP08514 1039 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 GM2AP17900 193 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 PRKCIP41743 596 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 RENBPP51606 427 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1024LP59773 190 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 AP1S1P61966 158 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 DPYSQ14117 519 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 ACOX1Q15067 660 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 CLEC14AQ86T13 490 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 LZTR1Q8N653 840 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-211ENST00000513325 GPR156Q8NFN8 814 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms