RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	MACC1	Q6ZN28	852 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLD5	Q8N7P1	536 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFFL	Q8WZ73	363 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	FATE1	Q969F0	183 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF157	Q96PX1	679 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM14	Q96QK8	99 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC61	Q9BV99	259 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM5	Q9C035	493 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLPB	Q9H078	707 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	NT5M	Q9NPB1	228 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	DTL	Q9NZJ0	730 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	INTU	Q9ULD6	942 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACACA	Q13085	2346 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014		A8MX80	341 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF487	B1APH4	448 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TOR1B	O14657	336 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MATN3	O15232	486 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGLS	O95336	258 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCA5L	O95447	670 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPM1	P09493	284 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CKMT1A	P12532	417 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LHCGR	P22888	699 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP25	P42331	645 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	INPP5A	Q14642	412 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNGA3	Q16281	694 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP58	Q5T655	872 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOLD1	Q96LR9	279 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	COQ10A	Q96MF6	247 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOO	Q9BUR5	198 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFR2	Q9UP52	801 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1A2	Q9Y585	309 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0U1RQS6	177 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	AQP9	O43315	295 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCCB	P05166	539 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-DQB2	P05538	268 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDHA1	P08559	390 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	FECH	P22830	423 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNC	P24863	283 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PEX5	P50542	639 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF75D	P51815	510 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	RP1	P56715	2156 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ILK	Q13418	452 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTM1	Q13496	603 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf61	Q13536	156 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFATC4	Q14934	902 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALG11	Q2TAA5	492 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	HES3	Q5TGS1	186 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	VSIG1	Q86XK7	387 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MDM1	Q8TC05	714 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMX1A	Q8TE12	382 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDAC11	Q96DB2	347 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBATA	Q96M53	351 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMA3C	Q99985	751 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRD1	A4D1F6	860 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BM21	787 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CP	P00450	1065 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRL	P01236	227 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP2	P08253	660 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELFN1	P0C7U0	828 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDK4	P11802	303 aa		12.74	□□□□□ -0.37

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