RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504788.5

LMNB1-208, Transcript of lamin B1, human

TSL 2

Gene LMNB1, Length 1,801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNB1-208	ENST00000504788	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788		E7ESA3	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788		H0Y858	1186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	DLL1	O00548	723 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	WNT9A	O14904	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	AXIN1	O15169	862 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	BNIP3L	O60238	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ECEL1	O95672	775 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	NDST3	O95803	873 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	IFNB1	P01574	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	TPSB2	P20231	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SERPINA4	P29622	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	GRIA4	P48058	902 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	FNTB	P49356	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	NEK3	P51956	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	DR1	Q01658	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SEMG2	Q02383	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ACVR1	Q04771	509 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	GALNT3	Q14435	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	CNGA3	Q16281	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	MCU	Q8NE86	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788		A0A1W2PQ67	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	RAD51B	O15315	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF217	O75362	1048 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	AVIL	O75366	819 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	PMPCB	O75439	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ANXA9	O76027	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	DNTT	P04053	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	C1S	P09871	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	PIRT	P0C851	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	MYBL2	P10244	700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	TGM1	P22735	817 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	ARNT	P27540	789 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	CD6	P30203	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	HMGCL	P35914	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	FDFT1	P37268	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	PTGER3	P43115	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SUOX	P51687	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	XIAP	P98170	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	CDK16	Q00536	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	LMNB2	Q03252	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	GPS1	Q13098	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LMNB1-208	ENST00000504788	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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