RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 ETNK2Q9NVF9 386 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 AMFRQ9UKV5 643 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CLEC4EQ9ULY5 219 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SNX12Q9UMY4 172 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 OR51B4Q9Y5P0 310 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.13□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.13□□□□□ -1.75
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CTPS1-212ENST00000498694 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM82A0PJX8 343 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ILVBLA1L0T0 632 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa4.12□□□□□ -1.75
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CTPS1-212ENST00000498694 RAMP2O60895 175 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TULP3O75386 442 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF205O95201 554 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 KCNH1O95259 989 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CD160O95971 181 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PEX11BO96011 259 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 APOC2P02655 101 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CYBBP04839 570 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PYGMP11217 842 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GLULP15104 373 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 RAC2P15153 192 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TCP1P17987 556 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TGM2P21980 687 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 KDELR1P24390 212 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MSNP26038 577 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SERPINB6P35237 376 aa4.12□□□□□ -1.75
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CTPS1-212ENST00000498694 ARL4AP40617 200 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CSKP41240 450 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HCAR3P49019 387 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PFKPQ01813 784 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 POU4F1Q01851 419 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GBE1Q04446 702 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GAD2Q05329 585 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 KDSRQ06136 332 aa4.12□□□□□ -1.75
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CTPS1-212ENST00000498694 SLC12A1Q13621 1099 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CDH18Q13634 790 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ENPP2Q13822 863 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 KRT81Q14533 505 aa4.12□□□□□ -1.75
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CTPS1-212ENST00000498694 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PARP15Q460N3 678 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 C4orf46Q504U0 113 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MPPE1Q53F39 396 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FSCBQ5H9T9 825 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SEL1L2Q5TEA6 688 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM215Q68D42 235 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CBLL1Q75N03 491 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
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CTPS1-212ENST00000498694 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 YAF2Q8IY57 180 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 AHI1Q8N157 1196 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC44A3Q8N4M1 653 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 UBL4BQ8N7F7 174 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 NAT16Q8N8M0 369 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 BVESQ8NE79 360 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FIBINQ8TAL6 211 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FATE1Q969F0 183 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 RNF157Q96PX1 679 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 OSBPL9Q96SU4 736 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CALN1Q9BXU9 219 aa4.12□□□□□ -1.75
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