RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497815.5

CUX1-210, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-210ENST00000497815 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.96□□□□□ -0.49
CUX1-210ENST00000497815 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 A0A0J9YYE9 177 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 A0A1W2PQU0 124 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ANKRD66B4E2M5 251 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 AREL1O15033 823 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PSMD3O43242 534 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 RAD51CO43502 376 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 TSPAN6O43657 245 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 MMP20O60882 483 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 TRBC1P01850 177 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 NFKBIAP25963 317 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ADRA1AP35348 466 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 MMP12P39900 470 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SUOXP51687 545 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PPP2CBP62714 309 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PPP2CAP67775 309 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ELP6Q0PNE2 266 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 TCF15Q12870 199 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SLC1A5Q15758 541 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 LPAL2Q16609 132 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 KCTD11Q693B1 232 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 TSPAN33Q86UF1 283 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 CEP112Q8N8E3 955 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SNX19Q92543 992 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SCRN2Q96FV2 425 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PRRX2Q99811 253 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 HINFPQ9BQA5 517 aa11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 CAPN8A6NHC0 703 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 MEI4A8MW99 385 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 AP1G1O43747 822 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 EPOP01588 193 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 FGF1P05230 155 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 TPH1P17752 444 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 HLA-DPA1P20036 260 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 LHCGRP22888 699 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 VIPR1P32241 457 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 CNR2P34972 360 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 GRIA1P42261 906 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 LIG3P49916 1009 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 RALGDSQ12967 914 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ARHGEF7Q14155 803 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 TMEM52BQ4KMG9 183 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 C8orf74Q6P047 294 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 RANBP10Q6VN20 620 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 DPPA4Q7L190 304 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 DNAAF3Q8N9W5 541 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 OR52K1Q8NGK4 314 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SPOCK2Q92563 424 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 DPH5Q9H2P9 285 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PREBQ9HCU5 417 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.94□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 FAM187AA6NFU0 413 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 IGLON5A6NGN9 336 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 LILRB5O75023 590 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 CLDN7O95471 211 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 IGHV4-34P06331 123 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 ELFN1P0C7U0 828 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 C6P13671 934 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PTGER3P43115 390 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 PTPN5P54829 565 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 SLC7A5Q01650 507 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 MTM1Q13496 603 aa11.93□□□□□ -0.5
CUX1-210ENST00000497815 KCNJ11Q14654 390 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms