RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 CTBP1Q13363 440 aa7.08□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 PRPSAP1Q14558 356 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PCLAFQ15004 111 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 KCTD11Q693B1 232 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.07□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.07□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 KLC1Q07866 573 aa7.07□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF460Q14592 562 aa7.07□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.07□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 COPG2Q9UBF2 871 aa7.07□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 MEI4A8MW99 385 aa7.06□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 GSC2O15499 205 aa7.06□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 VNN2O95498 520 aa7.06□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 LIMK2P53671 638 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MPP1Q00013 466 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CNGA3Q16281 694 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PSMD5Q16401 504 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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