RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 TMEM52BQ4KMG9 183 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 LRRC73Q5JTD7 316 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MARC1Q5VT66 337 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 GCNT7Q6ZNI0 430 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SLC35G2Q8TBE7 412 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 IFT43Q96FT9 208 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 BMFQ96LC9 184 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PSKH2Q96QS6 385 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 CHP1Q99653 195 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PACSIN1Q9BY11 444 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PCDH12Q9NPG4 1184 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 DNAJC28Q9NX36 388 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 GGT7Q9UJ14 662 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 A0A1W2PQ67 120 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 POM121BA6NF01 834 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TOR1BO14657 336 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 RAD51BO15315 384 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SDC3O75056 442 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 C1SP09871 688 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 KRT10P13645 584 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ITIH2P19823 946 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MAN1A1P33908 653 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ARHGAP25P42331 645 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ITKQ08881 620 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MMRN1Q13201 1228 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 FGL2Q14314 439 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SARM1Q6SZW1 724 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 GALNT15Q8N3T1 639 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 KLK13Q9UKR3 277 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 NENFQ9UMX5 172 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 WASF3Q9UPY6 502 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TRPM6Q9BX84 2022 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TSPAN11A1L157 253 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TMEM8BA6NDV4 472 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PROS1P07225 676 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 CKMT2P17540 419 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MX2P20592 715 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 DGKAP23743 735 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 IL4RP24394 825 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MMP13P45452 471 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 NOP2P46087 812 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 RGRP47804 291 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 LIG3P49916 1009 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 YPEL5P62699 121 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 DPYSL3Q14195 570 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 LRRC14Q15048 493 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SPA17Q15506 151 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ZNF542PQ5EBM4 170 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 RALGPS1Q5JS13 557 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 COX20Q5RI15 118 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PARGQ86W56 976 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 NDUFAF2Q8N183 169 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ATL2Q8NHH9 583 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 BTN2A2Q8WVV5 523 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 CENPTQ96BT3 561 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 ZNF670Q9BS34 389 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 TGIF2Q9GZN2 237 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 INTUQ9ULD6 942 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 LRRD1A4D1F6 860 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 CFAP69A5D8W1 941 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 FAM221BA6H8Z2 402 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MUSKO15146 869 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 FFAR2O15552 330 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SPINT1O43278 529 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 SIGLEC6O43699 453 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 MAFKO60675 156 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 RFPL3O75679 317 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 PIAS2O75928 621 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 CSF2P04141 144 aa10.41□□□□□ -0.74
TNS1-218ENST00000492338 CD48P09326 243 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms