RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484897.3

RPSAP58-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 58, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP58, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP58-201ENST00000484897 JUNDP17535 347 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 MX2P20592 715 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 CCNCP24863 283 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC1A1P43005 524 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 MARCKSL1P49006 195 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 AP1B1Q10567 949 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ACOX1Q15067 660 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 TCEAL1Q15170 157 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 KAZNQ674X7 775 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 LIPIQ6XZB0 460 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 DPPA4Q7L190 304 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 TEX26Q8N6G2 289 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 LMX1AQ8TE12 382 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 MAML1Q92585 1016 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 SMIM14Q96QK8 99 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 CEP41Q9BYV8 373 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 OR1A2Q9Y585 309 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ALG6Q9Y672 507 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 FAM149AA5PLN7 773 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 H3BM21 787 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 SOCS5O75159 536 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PGLSO95336 258 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 JCHAINP01591 159 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 CSF2P04141 144 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PDHA1P08559 390 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ALPIP09923 528 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 KRT10P13645 584 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 NME1P15531 152 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 GM2AP17900 193 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 VIPR1P32241 457 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 DAB2P98082 770 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 C1orf61Q13536 156 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PTK2BQ14289 1009 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 IHHQ14623 411 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 INPP5AQ14642 412 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 CNGA3Q16281 694 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 HS1BP3Q53T59 392 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 LRRC38Q5VT99 294 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC9A4Q6AI14 798 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 TSPAN33Q86UF1 283 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 HDAC11Q96DB2 347 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 TSGA13Q96PP4 275 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 APOOQ9BUR5 198 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 CHKBQ9Y259 395 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 IGF2RP11717 2491 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 GOLGA6CA6NDK9 693 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 GOLGA6BA6NDN3 693 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 AQP9O43315 295 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PSTPIP1O43586 416 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 RFPL3O75679 317 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 FECHP22830 423 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 LHCGRP22888 699 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ACADVLP49748 655 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 EPHB1P54762 984 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 YPEL5P62699 121 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ZBTB17Q13105 803 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PROX2Q3B8N5 592 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 FAXCQ5TGI0 409 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP58-201ENST00000484897 ENPP7Q6UWV6 458 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms