RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 MIIPQ5JXC2 388 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NAA35Q5VZE5 725 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 DTX1Q86Y01 620 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC185Q8N715 623 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 DKK3Q9UBP4 350 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TOR1BO14657 336 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RAMP2O60895 175 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RASGRP1O95267 797 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TNFP01375 233 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PCCBP05166 539 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ALPIP09923 528 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 JMJD7P0C870 316 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LIPCP11150 499 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CCL4P13236 92 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CHRNB2P17787 502 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LIG3P49916 1009 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 BLKP51451 505 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ARSDP51689 593 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MAPK10P53779 464 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 HDAC4P56524 1084 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NOMO3P69849 1222 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NFATC4Q14934 902 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CAMK4Q16566 473 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 VWA3BQ502W6 1294 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MANEAQ5SRI9 462 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 XKR5Q6UX68 686 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ARCQ7LC44 396 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 GKN2Q86XP6 184 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CCNJLQ8IV13 435 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PELI3Q8N2H9 469 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 HMCESQ96FZ2 354 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 EXOC2Q96KP1 924 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM74Q96NL1 305 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SEMA3CQ99985 751 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 STRADBQ9C0K7 418 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NDST4Q9H3R1 872 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM51Q9NW97 253 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LHX3Q9UBR4 397 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 APPL1Q9UKG1 709 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RP1P56715 2156 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RASA4BC9J798 803 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 J3KR12 359 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RASA4O43374 803 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LILRA1O75019 489 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 FUCA1P04066 466 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ITGB2P05107 769 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 GLB1P16278 677 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 GM2AP17900 193 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ETFBP38117 255 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RGRP47804 291 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 OR1D5P58170 312 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RHOAP61586 193 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RAD51Q06609 339 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PTP4A2Q12974 167 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MAN2A1Q16706 1144 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 UGP2Q16851 508 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms