RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	ZACN	Q401N2	412 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF585B	Q52M93	769 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912		Q5PR19	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	LIN54	Q6MZP7	749 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	MIB2	Q96AX9	1013 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TRANK1	O15050	2925 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	CKAP5	Q14008	2032 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PTPRF	P10586	1907 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	KLKB1	P03952	638 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PLA2G2A	P14555	144 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PRPH2	P23942	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	KLRC2	P26717	231 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC16A2	P36021	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	RFX2	P48378	723 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	GCKR	Q14397	625 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	RPS6KA2	Q15349	733 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	GALNTL6	Q49A17	601 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912		Q6ZTK2	550 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TRPV1	Q8NER1	839 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	AK9	Q5TCS8	1911 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912		F5H423	210 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	GRM8	O00222	908 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TCEA3	O75764	348 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF853	P0CG23	659 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SERPINF1	P36955	418 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	HMGCS2	P54868	508 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	AP2B1	P63010	937 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	ZXDB	P98169	803 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	G2E3	Q7L622	706 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	POF1B	Q8WVV4	589 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	NPAS1	Q99742	590 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PORCN	Q9H237	461 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	RNF146	Q9NTX7	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	WWOX	Q9NZC7	414 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	LRFN1	Q9P244	771 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	RCE1	Q9Y256	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	RLF	Q13129	1914 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	BECN2	A8MW95	431 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	ACKR2	O00590	384 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC28A2	O43868	658 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	CPA1	P15085	419 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	TNFSF8	P32971	234 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKD3-208	ENST00000475912	MLH1	P40692	756 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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