RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 USP44Q9H0E7 712 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 NOX4Q9NPH5 578 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.91□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 CCDC189A1A4V9 331 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TNFSF14O43557 240 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SHMT1P34896 483 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SLC39A14Q15043 492 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 TCTN1Q2MV58 587 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 ZNF114Q8NC26 417 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SCMH1Q96GD3 660 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 LMLNQ96KR4 655 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-210ENST00000472326 A0A1B0GVC2 190 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PQM1 296 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 BTBD18B2RXH4 712 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 WNT9BO14905 357 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CYC1P08574 325 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CHATP28329 748 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 ABCD1P33897 745 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 GNAQP50148 359 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 NEDD9Q14511 834 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 MALT1Q9UDY8 824 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SCINQ9Y6U3 715 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 PLSCR5A0PG75 271 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CPED1A4D0V7 1026 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SEC14L5O43304 696 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 NDUFS7O75251 213 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 MMP2P08253 660 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 IRF1P10914 325 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 G6PDP11413 515 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 COASYQ13057 564 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 MTSS1LQ765P7 747 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CNTROBQ8N137 903 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB2Q8N680 514 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 BEST2Q8NFU1 509 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 RND1Q92730 232 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 ADGRG7Q96K78 797 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 NFS1Q9Y697 457 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 GPTP24298 496 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 IL17REQ8NFR9 667 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 MTBPQ96DY7 904 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 GAREM1Q9H706 876 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SOCS6O14544 535 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 KDM4BO94953 1096 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SORDQ00796 357 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 DLG1Q12959 904 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 KIF19Q2TAC6 998 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 OR1F2PQ96R84 312 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 HAUS8Q9BT25 410 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 PREBQ9HCU5 417 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 TMEM202A6NGA9 273 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SMTNL1A8MU46 457 aa6.85□□□□□ -1.31
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