RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	GLRX5	Q86SX6	157 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	LMX1A	Q8TE12	382 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ASB12	Q8WXK4	309 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CENPT	Q96BT3	561 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FAF2	Q96CS3	445 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	LGMN	Q99538	433 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ALG6	Q9Y672	507 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQ67	120 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NEMP2	A6NFY4	417 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SCAMP1	O15126	338 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PSTPIP1	O43586	416 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PIAS2	O75928	621 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	JCHAIN	P01591	159 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DQB2	P05538	268 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	KRT10	P13645	584 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HTR1B	P28222	390 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PFN3	P60673	137 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	INPP5A	Q14642	412 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC181	Q5TID7	509 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC38	Q5VT99	294 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS13	Q6UX07	377 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	LIPI	Q6XZB0	460 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	USP45	Q70EL2	814 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DPPA4	Q7L190	304 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RBFA	Q8N0V3	343 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HAUS1	Q96CS2	278 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HDAC11	Q96DB2	347 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	OR1A2	Q9Y585	309 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SIGLEC6	O43699	453 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PGLS	O95336	258 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	LCA5L	O95447	670 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ALPI	P09923	528 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CTSE	P14091	401 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CR2	P20023	1033 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CA4	P22748	312 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	VIPR1	P32241	457 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	YPEL5	P62699	121 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RALGDS	Q12967	914 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf61	Q13536	156 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TFDP2	Q14188	446 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PDK1	Q15118	436 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HID1	Q8IV36	788 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A45	Q8N413	288 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TEX26	Q8N6G2	289 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PLD5	Q8N7P1	536 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	AGAP3	Q96P47	875 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CHKB	Q9Y259	395 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	LRP4	O75096	1905 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FAM149A	A5PLN7	773 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM38	O00635	465 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CST8	O60676	142 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RFPL3	O75679	317 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CSF2	P04141	144 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	C1QTNF9	P0C862	333 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MYF5	P13349	255 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CD86	P42081	329 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MARCKSL1	P49006	195 aa		14.85	□□□□□ -0.03

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