RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 BCL2L1Q07817 233 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAF2Q12933 501 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CST6Q15828 149 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PCSK7Q16549 785 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FAXCQ5TGI0 409 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM124AQ86V42 546 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 AADATQ8N5Z0 425 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC89Q8N998 374 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GANCQ8TET4 914 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RLN3Q8WXF3 142 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RTP4Q96DX8 246 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FCRL5Q96RD9 977 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT12Q99456 494 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GORASP1Q9BQQ3 440 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FBRSQ9HAH7 460 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 EBF1Q9UH73 591 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CHKBQ9Y259 395 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 INVSQ9Y283 1065 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 THADAQ6YHU6 1953 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC188H7C350 402 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 EFSO43281 561 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OPHN1O60890 802 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PMPCBO75439 489 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKCGP05129 697 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PDHA1P08559 390 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINF2P08697 491 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ARAFP10398 606 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ACADMP11310 421 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TDGF1P13385 188 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ITIH2P19823 946 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CD33P20138 364 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C5AR1P21730 350 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CES1P23141 567 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINA4P29622 427 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DRD3P35462 400 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MAPK8P45983 427 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FNTAP49354 379 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 VPS41P49754 854 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LMNB2Q03252 620 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CNTN1Q12860 1018 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBB2AQ13885 445 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PARP6Q2NL67 630 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 P3H1Q32P28 736 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RASSF3Q86WH2 238 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PAF1Q8N7H5 531 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FRMD1Q8N878 549 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OMDQ99983 421 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GBA3Q9H227 469 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DYRK4Q9NR20 520 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MYLKQ15746 1914 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms