RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 ATP6AP2O75787 350 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 OR1G1P47890 313 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TRIM32Q13049 653 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 KCNA10Q16322 511 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 UGT2A3Q6UWM9 527 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ARPINQ7Z6K5 226 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 GALNT4Q8N4A0 578 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TRIB2Q92519 343 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 IGSF8Q969P0 613 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 UBXN10Q96LJ8 280 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 RRAGCQ9HB90 399 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TMEM248Q9NWD8 314 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 RIMS3Q9UJD0 308 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TRIM38O00635 465 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TRPA1O75762 1119 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 PMLP29590 882 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 KCNC1P48547 511 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 STX5Q13190 355 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 GRM2Q14416 872 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 SQLEQ14534 574 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 PTPRCAPQ14761 206 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 MFSD14CQ5VZR4 134 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 IL31Q6EBC2 164 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 SLC22A9Q8IVM8 553 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 GALNT15Q8N3T1 639 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 OR52K2Q8NGK3 314 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 HMGCLL1Q8TB92 370 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 PCDHAC1Q9H158 963 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 RGS18Q9NS28 235 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 EPS15L1Q9UBC2 864 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TRAF6Q9Y4K3 522 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 E7ENX8 843 aa17■□□□□ 0.31
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ACTB-207ENST00000462494 SLC7A4O43246 635 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 SOAT2O75908 522 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 S1PR4O95977 384 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 PAX3P23760 479 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 YWHAQP27348 245 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 GSTT1P30711 240 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 GRIA2P42262 883 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 CNPY1Q3B7I2 92 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 REP15Q6BDI9 236 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 FBXL22Q6P050 247 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 LAYNQ6UX15 382 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 CHSY3Q70JA7 882 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 IFNL1Q8IU54 200 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ZNF683Q8IZ20 524 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 PGBD5Q8N414 524 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TTC9BQ8N6N2 239 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 DLG3Q92796 817 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 TBATAQ96M53 351 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 SPATA16Q9BXB7 569 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 MFSD1Q9H3U5 465 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 FBXO44Q9H4M3 255 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 GSTO2Q9H4Y5 243 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 Q9H521 79 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 FNIP2Q9P278 1114 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 MROH6A6NGR9 719 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 DNAJA2O60884 412 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 IMPDH1P20839 514 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ARPP19P56211 112 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 RALGDSQ12967 914 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
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ACTB-207ENST00000462494 PAOXQ6QHF9 649 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 CNBD2Q96M20 576 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ARL5AQ9Y689 179 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 FBP2O00757 339 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 CRTAMO95727 393 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 PIRTP0C851 137 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 CDH13P55290 713 aa16.98■□□□□ 0.31
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ACTB-207ENST00000462494 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 SLC14A2Q15849 920 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ISCA2Q86U28 154 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 OR9I1Q8NGQ6 314 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 SEMA3CQ99985 751 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 GABRQQ9UN88 632 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-207ENST00000462494 AP4B1Q9Y6B7 739 aa16.98■□□□□ 0.31
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