RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 DKK1O94907 266 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 HLA-DQB2P05538 268 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 PDHA1P08559 390 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 ELFN1P0C7U0 828 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 JUNDP17535 347 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 CCNCP24863 283 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
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SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 PELI3Q8N2H9 469 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 SPC24Q8NBT2 197 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 GATA6Q92908 595 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 CEP41Q9BYV8 373 aa24.01■■□□□ 1.43
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SH3BP5-208ENST00000459627 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
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SH3BP5-208ENST00000459627 TSPAN33Q86UF1 283 aa24■■□□□ 1.43
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SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC13Q8IYE1 715 aa24■■□□□ 1.43
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SH3BP5-208ENST00000459627 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
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SH3BP5-208ENST00000459627 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 CHKBQ9Y259 395 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 K7ESM1 405 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 GCATO75600 419 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 RFPL3O75679 317 aa23.97■■□□□ 1.43
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SH3BP5-208ENST00000459627 FECHP22830 423 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 LHCGRP22888 699 aa23.97■■□□□ 1.43
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SH3BP5-208ENST00000459627 AP1B1Q10567 949 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 PTK2BQ14289 1009 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 FAXCQ5TGI0 409 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 MACC1Q6ZN28 852 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 RFLNAQ6ZTI6 216 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 RD3Q7Z3Z2 195 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT35Q92764 455 aa23.97■■□□□ 1.43
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