RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 OR56A4Q8NGH8 313 aa26.53■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 PISDQ9UG56 409 aa26.53■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 LOXL2Q9Y4K0 774 aa26.53■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEF11O60813 436 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 KELP23276 732 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 CSNK1DP48730 415 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 KRT31Q15323 416 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 CERCAMQ5T4B2 595 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 CDKAL1Q5VV42 579 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 ZSWIM9Q86XI8 627 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 CAMK1DQ8IU85 385 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 SGF29Q96ES7 293 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 MCEEQ96PE7 176 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 CNPY3Q9BT09 278 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa26.52■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 J3KR12 359 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 DESP17661 470 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SERPINA4P29622 427 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TPI1P60174 286 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TGIF1Q15583 401 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 KCTD16Q68DU8 428 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 USP53Q70EK8 1073 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PLA2G15Q8NCC3 412 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 OR1E3Q8WZA6 343 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SEPT10Q9P0V9 454 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SIK3Q9Y2K2 1263 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 MYO18BQ8IUG5 2567 aa26.51■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM202A6NGA9 273 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TNFRSF10CO14798 259 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 ITGB2P05107 769 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 KCNC4Q03721 635 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 C14orf28Q4W4Y0 310 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TAF8Q7Z7C8 310 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SRLQ86TD4 932 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 FAM46DQ8NEK8 389 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 FGF22Q9HCT0 170 aa26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 WISP1O95388 367 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PRKCGP05129 697 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 RALGDSQ12967 914 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 LINC00303Q3SY05 128 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SPRED1Q7Z699 444 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 EXD3Q8N9H8 876 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 ECHDC3Q96DC8 303 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 CMKLR1Q99788 373 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.49■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGAP42A6NI28 874 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 ELFN1P0C7U0 828 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 ITIH1P19827 911 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 RGRP47804 291 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 LIPIQ6XZB0 460 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 FAM117AQ9C073 453 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 LRIT1Q9P2V4 623 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 RNF215Q9Y6U7 377 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 UNC13CQ8NB66 2214 aa26.48■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PALMO75781 387 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM23P36406 574 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 BCL2L1Q07817 233 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 NFATC3Q12968 1075 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGEF7Q14155 803 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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PBRM1-218ENST00000458294 DCUN1D2Q6PH85 259 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 NEK11Q8NG66 645 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 AGPAT1Q99943 283 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SLC39A8Q9C0K1 460 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM168Q9H0V1 697 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 DPEP2Q9H4A9 486 aa26.47■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 B4DGG1 531 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEF10O60809 474 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 KRT10P13645 584 aa26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PBRM1-218ENST00000458294 MANEAQ5SRI9 462 aa26.46■■□□□ 1.83
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