RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GM2AP17900 193 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TGM2P21980 687 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PFN3P60673 137 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BNIP3Q12983 259 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WSCD2Q2TBF2 565 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LIPIQ6XZB0 460 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAF1Q8N7H5 531 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM174AQ8TBP5 190 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIH1D2Q8WWB5 315 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP41Q9BYV8 373 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 B4GALT6Q9UBX8 382 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHTF1Q9UMS5 762 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1W2PQ67 120 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP69A5D8W1 941 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FLRT2O43155 660 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADRB1P08588 477 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CES1P23141 567 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXK2Q01167 660 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGERQ15109 404 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARMC12Q5T9G4 340 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HAUS1Q96CS2 278 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM14Q96QK8 99 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRD8Q9H0E9 1235 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC66A2RUB6 948 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP6O43182 974 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEBLO76041 1014 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RABIFP47224 123 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COPS2P61201 443 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FZD2Q14332 565 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IRF4Q15306 451 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AADACL2Q6P093 401 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BBS12Q6ZW61 710 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OXR1Q8N573 874 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEPT10Q9P0V9 454 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPIL1Q9Y3C6 166 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPEGQ15772 3267 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCNX2A6NKB5 2137 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FTCDO95954 541 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRLP01236 227 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LHCGRP22888 699 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RWDD2BP57060 319 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SKOR1P84550 965 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC14Q15048 493 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RHBDD1Q8TEB9 315 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 P3H4Q92791 437 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCRN2Q96FV2 425 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGAP3Q96P47 875 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AMFRQ9UKV5 643 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YKT6O15498 198 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SDC3O75056 442 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALPIP09923 528 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ELFN1P0C7U0 828 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PYGMP11217 842 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTPS1P17812 591 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPN3P26045 913 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VIPR1P32241 457 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPN7P35236 360 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD86P42081 329 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCZ1BP86790 482 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNGA3Q16281 694 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF542PQ5EBM4 170 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PEX26Q7Z412 305 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HAUS2Q9NVX0 235 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHKBQ9Y259 395 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRK1Q38SD2 2015 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0U1RQS6 177 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA8CPA6NN73 597 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGAVP06756 1048 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRK6P43250 576 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WASHC5Q12768 1159 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX44Q53QW1 395 aa25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms