RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423725.5

NDUFS1-202, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NDUFS1, Length 2,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-202ENST00000423725 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.61□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 A0A0D9SEW6 157 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 A0A0U1RQS6 177 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 MROH6A6NGR9 719 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SEPT4O43236 478 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 TADA2AO75478 443 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 OR6B1O95007 311 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PGM3O95394 542 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 ETS2P15036 469 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 ME2P23368 584 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 FOXA1P55317 472 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PRKCZQ05513 592 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PDK3Q15120 406 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 FAM110BQ8TC76 370 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SEMA3CQ99985 751 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 KPNA6O60684 536 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 TRPA1O75762 1119 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 OAZ2O95190 189 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CSPG5O95196 566 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 TYMPP19971 482 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 DNAJB13P59910 316 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PRAMEP78395 509 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 TAF10Q12962 218 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PTK2BQ14289 1009 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PTPRRQ15256 657 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 AGKQ53H12 422 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 IL23RQ5VWK5 629 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 LCA5Q86VQ0 697 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SPATA24Q86W54 205 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 GBP5Q96PP8 586 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SERPINI1Q99574 410 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 TRIM62Q9BVG3 475 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SPC25Q9HBM1 224 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 VPS45Q9NRW7 570 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PDP2Q9P2J9 529 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SCML2Q9UQR0 700 aa9.6□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 WASH4PA8MWX3 477 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 H3BMM5 538 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 UBDO15205 165 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 FESP07332 822 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 RHOQP17081 205 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 OR1E1P30953 314 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 GATMP50440 423 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 KCNQ1P51787 676 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SH3BP2P78314 561 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CDKL1Q00532 357 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CHSY3Q70JA7 882 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SATL1Q86VE3 508 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 EXOC2Q96KP1 924 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 KCNA7Q96RP8 456 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 RGS18Q9NS28 235 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.59□□□□□ -0.87
NDUFS1-202ENST00000423725 SLC12A8A0AV02 714 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms