RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CALML6Q8TD86 181 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MOCOSQ96EN8 888 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 POM121Q96HA1 1249 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FEM1CQ96JP0 617 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NSMCE3Q96MG7 304 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RILPQ96NA2 401 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM237Q96Q45 408 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM14Q96QK8 99 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PSKH2Q96QS6 385 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM167BQ9BTA0 163 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 IL23AQ9NPF7 189 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ACSS2Q9NR19 701 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PLK2Q9NYY3 685 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS28Q9UK41 221 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 STK38LQ9Y2H1 464 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ACOT9Q9Y305 439 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO7AQ13402 2215 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PRU2 124 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 INSIG1O15503 277 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LDB2O43679 373 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BAIAP3O94812 1187 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NDST3O95803 873 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 IL1BP01584 269 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EPOP01588 193 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF1P05230 155 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 C8AP07357 584 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PDHA1P08559 390 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35E2BP0CK96 405 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MYL4P12829 197 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB10P61026 200 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TNK2Q07912 1038 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC12A1Q13621 1099 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH18Q13634 790 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CYTH1Q15438 398 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ATG14Q6ZNE5 492 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CHST9Q7L1S5 443 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CLNKQ7Z7G1 428 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC7BQ86TV6 843 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OR13C4Q8NGS5 318 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BRSK1Q8TDC3 778 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP4R1Q8TF05 950 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DDI1Q8WTU0 396 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TADA1Q96BN2 335 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NXNL1Q96CM4 212 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RANBP9Q96S59 729 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MGME1Q9BQP7 344 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CORO1BQ9BR76 489 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBP1Q9H171 429 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RETREG1Q9H6L5 497 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PNPOQ9NVS9 261 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 COL4A6Q14031 1691 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMA3Q16787 3333 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CARNS1A5YM72 827 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MROH6A6NGR9 719 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 G3V2L1 256 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL16O15467 120 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC7A4O43246 635 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM13O60858 407 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SIN3BO75182 1162 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RASSF9O75901 435 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TMCC1O94876 653 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ADH1AP07327 375 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO45P0C2W1 286 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 T-ENOLP0DO92 83 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GRK2P25098 689 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARRB2P32121 409 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC8A1P32418 973 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LBX1P52954 281 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVFC1P60507 584 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARF5P84085 180 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CSHL1Q14406 222 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DBN1Q16643 649 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EML3Q32P44 896 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PLPP4Q5VZY2 271 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NAPRTQ6XQN6 538 aa4□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms