RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 GGT7Q9UJ14 662 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CHKBQ9Y259 395 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PRU2 124 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 C2orf81A6NN90 581 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 DLDP09622 509 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SLC35E2BP0CK96 405 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 MYL2P10916 166 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SAT1P21673 171 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GLDCP23378 1020 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GABRB3P28472 473 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HOXA9P31269 272 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 AVPR1AP37288 418 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CSKP41240 450 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ABCG1P45844 678 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SLC1A6P48664 564 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RHOAP61586 193 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ZBTB16Q05516 673 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CYTH1Q15438 398 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 DLG2Q15700 870 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 KLC3Q6P597 504 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GPR150Q8NGU9 434 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HDAC10Q969S8 669 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ECT2Q9H8V3 914 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 E2F8A0AVK6 867 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CCL16O15467 120 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM13O60858 407 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 DNAJC6O75061 913 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 XYLBO75191 536 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ZMPSTE24O75844 475 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HAUS5O94927 633 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 UNC5CO95185 931 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 KLHL2O95198 593 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GSRP00390 522 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PTPN2P17706 415 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SLC26A3P40879 764 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CLCN4P51793 760 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 EPHA5P54756 1037 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 C1QTNF8P60827 252 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 IRF9Q00978 393 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 IHHQ14623 411 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 C10orf107Q8IVU9 208 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RFWD2Q8NHY2 731 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 POF1BQ8WVV4 589 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SCYL1Q96KG9 808 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 EXOC2Q96KP1 924 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SAR1AQ9NR31 198 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 VPS51Q9UID3 782 aa11.18□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GBF1Q92538 1859 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 C5orf67F2Z3F1 127 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LEFTY2O00292 366 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SNAP91O60641 907 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GJB3O75712 270 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PRKCGP05129 697 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RB1P06400 928 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RGRP47804 291 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GRIA4P48058 902 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HK2P52789 917 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ERVFC1P60507 584 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 NCALDP61601 193 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SLC20A2Q08357 652 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ITGA9Q13797 1035 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TBCCQ15814 346 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 FSCBQ5H9T9 825 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms