RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393747.3

CTTN-204, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 5

Gene CTTN, Length 1,315 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-204ENST00000393747 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 PCDH19Q8TAB3 1148 aa18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 SPOCK2Q92563 424 aa18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 HSPH1Q92598 858 aa18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 HIC2Q96JB3 615 aa18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 ABCG4Q9H172 646 aa18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 EVA1BQ9NVM1 165 aa18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 SEPT3Q9UH03 358 aa18.09■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 A0A087X0T9 212 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 CFAP69A5D8W1 941 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 H3BRJ5 948 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 MAFKO60675 156 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 FAM228BP0C875 321 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 SRP54P61011 504 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 AP1S1P61966 158 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 GABREP78334 506 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 MTM1Q13496 603 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 BOLA3Q53S33 107 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 ENPP7Q6UWV6 458 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 KYQ8NBH2 561 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 ZNF599Q96NL3 588 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 PRORYQ9H606 182 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 PCDH18Q9HCL0 1135 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 ASCL3Q9NQ33 180 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 RABGEF1Q9UJ41 708 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 NENFQ9UMX5 172 aa18.08■□□□□ 0.49
CTTN-204ENST00000393747 BAHCC1Q9P281 2608 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 TMEM202A6NGA9 273 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 RASGRP1O95267 797 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 CYP1A2P05177 515 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 IL4RP24394 825 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ACTN2P35609 894 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 LSSP48449 732 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 TLE3Q04726 772 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 CPNE8Q86YQ8 564 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ARL10Q8N8L6 244 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 TEKT4Q8WW24 435 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 OR1E3Q8WZA6 343 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 MGME1Q9BQP7 344 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 FGF22Q9HCT0 170 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 KLQ9UEF7 1012 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 PADI4Q9UM07 663 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa18.07■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 A8MX80 341 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 RRP8O43159 456 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 GYPCP04921 128 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 SERPING1P05155 500 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 CD48P09326 243 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ELFN1P0C7U0 828 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ARL4AP40617 200 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 BLKP51451 505 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 UBASH3AP57075 661 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 KIAA1024LP59773 190 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ZBED6P86452 979 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 TRAF2Q12933 501 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ELOCQ15369 112 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 RD3Q7Z3Z2 195 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 SPACA3Q8IXA5 215 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 NAT6Q93015 286 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 COQ10AQ96MF6 247 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 WDR92Q96MX6 357 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 CCDC3Q9BQI4 270 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 NUP85Q9BW27 656 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 LGR4Q9BXB1 951 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 NOD2Q9HC29 1040 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 SIRPGQ9P1W8 387 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ANAPC7Q9UJX3 599 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 RP1P56715 2156 aa18.06■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 LRRK1Q38SD2 2015 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 LHCGRP22888 699 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 HTR1BP28222 390 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 TRIM23P36406 574 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 RPIAP49247 311 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 RENBPP51606 427 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ARSEP51690 589 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 MAXP61244 160 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 MMRN1Q13201 1228 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 ZNF235Q14590 738 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 PTPRRQ15256 657 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 CNGA3Q16281 694 aa18.05■□□□□ 0.48
CTTN-204ENST00000393747 LVRNQ6Q4G3 990 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms