RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384667.1

RNU6-1179P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1179, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1179P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 A0A1B0GVM2 712 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CD8B2A6NJW9 211 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SCAMP1O15126 338 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ITM2AO43736 263 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 LIASO43766 372 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 RGS11O94810 467 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 BMP15O95972 392 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 HOXC6P09630 235 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SCP2P22307 547 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 NFKBIAP25963 317 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 MLH1P40692 756 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 NUDT6P53370 316 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PRAMEP78395 509 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ECT2LQ008S8 904 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 DSC1Q08554 894 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 NIPAL4Q0D2K0 466 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 LMOD3Q0VAK6 560 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 Q0VFX4 171 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TRAF2Q12933 501 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 GPS2Q13227 327 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 NEDD9Q14511 834 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ALG11Q2TAA5 492 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 EFHC1Q5JVL4 640 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SPATA1Q5VX52 437 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PDXDC1Q6P996 788 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 BRINP3Q76B58 766 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TDRPQ86YL5 185 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 WDR63Q8IWG1 891 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 FRMD1Q8N878 549 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 HUS1BQ8NHY5 278 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 GPT2Q8TD30 523 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 KCNG4Q8TDN1 519 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SCARB1Q8WTV0 552 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 NSMCE1Q8WV22 266 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TRIB2Q92519 343 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 USP6NLQ92738 828 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PERPQ96FX8 193 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CCDC34Q96HJ3 373 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SLC41A2Q96JW4 573 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TMEM68Q96MH6 324 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 LRFN5Q96NI6 719 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ZNF570Q96NI8 536 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ITPAQ9BY32 194 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 DCLK3Q9C098 648 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PAM16Q9Y3D7 125 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 A0A1W2PQF6 199 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TMEM202A6NGA9 273 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PTP4A3O75365 173 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TIPRLO75663 272 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 VNN2O95498 520 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 IGKV2-30P06310 120 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CDC25AP30304 524 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TM4SF1P30408 202 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PBX3P40426 434 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 AMTP48728 403 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ZBED6P86452 979 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 MYBPC2Q14324 1141 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 HNF4GQ14541 408 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SLC45A4Q5BKX6 768 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 AWAT2Q6E213 333 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 TSSK4Q6SA08 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 LCTLQ6UWM7 567 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 NOXA1Q86UR1 476 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SLC35F3Q8IY50 421 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 HACE1Q8IYU2 909 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 AADATQ8N5Z0 425 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 ZBTB2Q8N680 514 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PDILTQ8N807 584 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SCFD2Q8WU76 684 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1179P-201ENST00000384667 SH3GL2Q99962 352 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms