RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384569.1

SNORD56.6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.6-201ENST00000384569 IRX4P78413 519 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 NTHL1P78549 312 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 POU4F1Q01851 419 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC20A2Q08357 652 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRAF2Q12933 501 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CTBP1Q13363 440 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SHHQ15465 462 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CHI3L2Q15782 390 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CNGA3Q16281 694 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 INSCQ1MX18 579 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 FUT11Q495W5 492 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 FSCBQ5H9T9 825 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CFAP157Q5JU67 520 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ARTNQ5T4W7 220 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 NEPROQ6NW34 567 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SPRED2Q7Z698 418 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CRLF3Q8IUI8 442 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 STK40Q8N2I9 435 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CPA6Q8N4T0 437 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR52K2Q8NGK3 314 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 WFDC5Q8TCV5 224 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 BRSK1Q8TDC3 778 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 IRF7Q92985 503 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ISL2Q96A47 359 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 E2F7Q96AV8 911 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SIKE1Q9BRV8 207 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 FEM1AQ9BSK4 669 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PBX4Q9BYU1 374 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 GPAMQ9HCL2 828 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 MARK1Q9P0L2 795 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 FBXO5Q9UKT4 447 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLLPQ9Y342 182 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ARL5AQ9Y689 179 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRPM6Q9BX84 2022 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM114B3SHH9 223 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 F8W8V4 182 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCL22O00626 93 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 KLF11O14901 512 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 LDB2O43679 373 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SNX3O60493 162 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 GREM1O60565 184 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLIN3O60664 434 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 EDF1O60869 148 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 VPS26AO75436 327 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 NDUFS3O75489 264 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 GJB3O75712 270 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZMPSTE24O75844 475 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 SRP72O76094 671 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 ARHGEF15O94989 841 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PGLSO95336 258 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 PIGNO95427 931 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD56.6-201ENST00000384569 HSPA4LO95757 839 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms