RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360047.9

PDE4D-205, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-205ENST00000360047 CLSTN3Q9BQT9 956 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 GIN1Q9NXP7 522 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 IRAK3Q9Y616 596 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ATP8B3O60423 1300 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 MYO7AQ13402 2215 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 A0A1B0GVC2 190 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 PCP4L1A6NKN8 68 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 KERAO60938 352 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ENTPD5O75356 428 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 KLHL2O95198 593 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 STMN1P16949 149 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 HMOX2P30519 316 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 KLK7P49862 253 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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PDE4D-205ENST00000360047 HSPA14Q0VDF9 509 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 SMARCB1Q12824 385 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 CAMK1Q14012 370 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ADGRE1Q14246 886 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 TGFBIQ15582 683 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ZNF674Q2M3X9 581 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 MGAT5BQ3V5L5 792 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 FUT11Q495W5 492 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 SIGIRRQ6IA17 410 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 SCN4BQ8IWT1 228 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 C10orf53Q8N6V4 93 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 OR7G1Q8NGA0 311 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 LMO3Q8TAP4 145 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 CEP76Q8TAP6 659 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 POC1BQ8TC44 478 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 TMEM176AQ96HP8 235 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 UBXN10Q96LJ8 280 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 NOX5Q96PH1 765 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ERGIC2Q96RQ1 377 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 CTRCQ99895 268 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 LPIN3Q9BQK8 851 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 NEURL2Q9BR09 285 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 BCO2Q9BYV7 579 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 CEP44Q9C0F1 390 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 TTYH3Q9C0H2 523 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ADAM19Q9H013 955 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 SDCBP2Q9H190 292 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-205ENST00000360047 CLDND1Q9NY35 253 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 EHD3Q9NZN3 535 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-205ENST00000360047 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 PTPRSQ13332 1948 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 MYBPHLA2RUH7 354 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 F8W8V4 182 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 CCDC188H7C350 402 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-205ENST00000360047 ADAM12O43184 909 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 FRS3O43559 492 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 MICAL2O94851 1124 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ABLIM3O94929 683 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 LRG1P02750 347 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 UCHL3P15374 230 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 KELP23276 732 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-205ENST00000360047 PTK2Q05397 1052 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 GPR17Q13304 367 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 DOC2AQ14183 400 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 DUSP6Q16828 381 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 INSCQ1MX18 579 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 PPM1LQ5SGD2 360 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-205ENST00000360047 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-205ENST00000360047 CADM3Q8N126 398 aa5□□□□□ -1.61
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