RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356713.4

CNNM1-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM1, Length 5,959 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1-201ENST00000356713 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.17■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 TLL1O43897 1013 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 AVILO75366 819 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 TFPIP10646 304 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 RNF157Q96PX1 679 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 DNTTP04053 509 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 DIP2AQ14689 1571 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 GCATO75600 419 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 HOXC6P09630 235 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 SEMA5AQ13591 1074 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 C12orf29Q8N999 325 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PIGKQ92643 395 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CD101Q93033 1021 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 SCRN3Q0VDG4 424 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 OR4L1Q8NH43 312 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 DLC1Q96QB1 1528 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ATP6AP2O75787 350 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 SEC24AO95486 1093 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ADSSP30520 456 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 BAP1Q92560 729 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 KAZALD1Q96I82 304 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ITCHQ96J02 903 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PWWP2AQ96N64 755 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 OR52E6Q96RD3 313 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 RFXANKO14593 260 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CXCL14O95715 111 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 SMIM11AP58511 58 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PSEN1P49768 467 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 GRB14Q14449 540 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 GPR180Q86V85 440 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PPCDCQ96CD2 204 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 STX16O14662 325 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 S100GP29377 79 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PUDPQ08623 228 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 QPRTQ15274 297 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 DEPDC4Q8N2C3 294 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CLEC4AQ9UMR7 237 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 BTN3A3O00478 584 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 TTMPQ5BVD1 217 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.15■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.14■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.14■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.14■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.14■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 CASZ1Q86V15 1759 aa20.14■□□□□ 0.82
CNNM1-201ENST00000356713 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 TRIM38O00635 465 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 PLOD3O60568 738 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 DGKZQ13574 1117 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 NR1D2Q14995 579 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 HDAC10Q969S8 669 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF607Q96SK3 696 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 CDT1Q9H211 546 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 TMCC2O75069 709 aa20.14■□□□□ 0.81
CNNM1-201ENST00000356713 ITPKAP23677 461 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms