RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 AZIN1O14977 448 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 B4GALT4O60513 344 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PSMD10O75832 226 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ITGA2BP08514 1039 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 GLRA2P23416 452 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PSMB4P28070 264 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HSD17B2P37059 387 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DACT2Q5SW24 774 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CRELD1Q96HD1 420 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PROCP04070 461 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ELFN1P0C7U0 828 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PRG2P13727 222 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC6A2P23975 617 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 GPR1P46091 355 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PTP4A2Q12974 167 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ROPN1LQ96C74 230 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CDRT15Q96T59 188 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CDH19Q9H159 772 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MTRRQ9UBK8 725 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ATP12AP54707 1039 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PLD4Q96BZ4 506 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HAT1O14929 419 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HGFP14210 728 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM38O00635 465 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC166P0CW27 439 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 COX4I1P13073 169 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LAG3P18627 525 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BDNFP23560 247 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC26A3P40879 764 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGDIBP52566 201 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 OR4L1Q8NH43 312 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 EHD3Q9NZN3 535 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0B4J269 797 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NR2F6P10588 404 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ASB8Q9H765 288 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BRD9Q9H8M2 597 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MCIDASD6RGH6 385 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PER2O15055 1255 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SSTR1P30872 391 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LY6KQ17RY6 165 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ZACNQ401N2 412 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 GPR180Q86V85 440 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA20Q8TB22 786 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BAP1Q92560 729 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MYO19Q96H55 970 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PNMA5Q96PV4 448 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TMCC2O75069 709 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NR2C1P13056 603 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TCF4P15884 667 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PDX1P52945 283 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 FAM189A2Q15884 450 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms