RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GFAPP14136 432 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TKTL1P51854 596 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC12A2P55011 1212 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC80Q76M96 950 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 LINC00523Q86TU6 105 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 FUNDC1Q8IVP5 155 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CHST13Q8NET6 341 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 HSFY1Q96LI6 401 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 RMI1Q9H9A7 625 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 KRBA1A5PL33 1030 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GSTT2P0CG29 244 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GSTT2BP0CG30 244 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ERCC2P18074 760 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GPX3P22352 226 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 YWHAQP27348 245 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 OXTRP30559 389 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MAPK10P53779 464 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CTBP1Q13363 440 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX17Q15036 470 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 AMHR2Q16671 573 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 LY6KQ17RY6 165 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 VAT1Q99536 393 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GPR20Q99678 358 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 A8MT66 165 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NR5A2O00482 541 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ARPC2O15144 300 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 RFC2P35250 354 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GRM5P41594 1212 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GJA9P57773 515 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 OXA1LQ15070 435 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF19Q2TAC6 998 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATS1Q496A3 300 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 BROXQ5VW32 411 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF347Q96SE7 839 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MROQ9BYG7 248 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MUC13Q9H3R2 512 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 SCN1AP35498 2009 aa20.33■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A0J9YYE9 177 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 H0YAE9 185 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PSMD3O43242 534 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 TAS2R39P59534 338 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 POU5F1BQ06416 359 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF846Q147U1 533 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PCID2Q5JVF3 399 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SFRP1Q8N474 314 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 LEMD2Q8NC56 503 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 HDAC11Q96DB2 347 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 LRCH3Q96II8 777 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGED4Q96JG8 741 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP10Q9P2G4 905 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CPQQ9Y646 472 aa20.33■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 POU4F1Q01851 419 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP51A1Q16850 503 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX19Q92543 992 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 UBP1Q9NZI7 540 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 FZD1Q9UP38 647 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 M0QYT0 321 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ANGPT2O15123 496 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPRAP18433 802 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 EDNRBP24530 442 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CSHL1Q14406 222 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PLCL1Q15111 1095 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 EML3Q32P44 896 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms