RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 FAM171BQ6P995 826 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 SLC2A14Q8TDB8 520 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 TMEM176AQ96HP8 235 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 MAGED4Q96JG8 741 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 CABS1Q96KC9 395 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 SLC2A13Q96QE2 648 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 NUP58Q9BVL2 599 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 SPATA9Q9BWV2 254 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 CEP44Q9C0F1 390 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 ZBP1Q9H171 429 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 TMEM245Q9H330 911 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 MBD2Q9UBB5 411 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 SPATA2Q9UM82 520 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
TRDN-201ENST00000334268 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 A8MUI8 341 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 H3BNC9 293 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MYO1FO00160 1098 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NCAM2O15394 837 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PRODHO43272 600 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ATP8B1O43520 1251 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TRAPPC3O43617 180 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ACSL4O60488 711 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CYTIPO60759 359 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FAM153BP0C7A2 387 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SPATA31D3P0C874 917 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DHRS4L1P0CG22 281 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MYBL1P10243 752 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CTSAP10619 480 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CCDC130P13994 396 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CD19P15391 556 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CES1P23141 567 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 WARSP23381 471 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PGFP49763 221 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PFKPQ01813 784 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LGALS3BPQ08380 585 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SQSTM1Q13501 440 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GRIN2CQ14957 1233 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 USP41Q3LFD5 358 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LILRA6Q6PI73 481 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC35F6Q8N357 371 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMEM104Q8NE00 496 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FAM174AQ8TBP5 190 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 KCNE4Q8WWG9 221 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SGK3Q96BR1 496 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ACBD6Q9BR61 282 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GSDMCQ9BYG8 508 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LACRTQ9GZZ8 138 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF576Q9H609 170 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SAMD15Q9P1V8 674 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NAGPAQ9UK23 515 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TSPAN16Q9UKR8 245 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 IRAK3Q9Y616 596 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 H7C1Q1 480 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PIP5K1BO14986 540 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SYN3O14994 580 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ULK1O75385 1050 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LCA5LO95447 670 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SEC24AO95486 1093 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PCCBP05166 539 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PET100P0DJ07 73 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 UNGP13051 313 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms