RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 TRIM69Q86WT6 500 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SNX19Q92543 992 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA13Q96N96 652 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 TRIB3Q96RU7 358 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 A0A0U1RQS6 177 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 C5orf60A6NFR6 353 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 A8MX80 341 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 CPP00450 1065 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 RALGDSQ12967 914 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 NEK5Q6P3R8 708 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 KDELC1Q6UW63 502 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 HORMAD1Q86X24 394 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PPC4 97 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PATE3B3GLJ2 98 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 TSPAN6O43657 245 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 MMP20O60882 483 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 CTPS1P17812 591 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 TGM1P22735 817 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 MMP12P39900 470 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 KCNJ1P48048 391 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 SUOXP51687 545 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 SYT12Q8IV01 421 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PAF1Q8N7H5 531 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 RTP4Q96DX8 246 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 GBA3Q9H227 469 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 IGLON5A6NGN9 336 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 NEMP1O14524 444 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PMPCBO75439 489 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 ALPIP09923 528 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 CD27P26842 260 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 MPLP40238 635 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PCSK7Q16549 785 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 FEM1CQ96JP0 617 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 NCDNQ9UBB6 729 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PLXNA2O75051 1894 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 LAMA1P25391 3075 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PQ67 120 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 GCATO75600 419 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 METTL18O95568 372 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 ETS1P14921 441 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PSMB4P28070 264 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 SPEM2Q0P670 501 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 TERF2Q15554 542 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 SCRN2Q96FV2 425 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 SLC31A1O15431 190 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 ITGAVP06756 1048 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 GM2AP17900 193 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 LHCGRP22888 699 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 TNFRSF8P28908 595 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 HNF1BP35680 557 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 DMTNQ08495 405 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 ELP6Q0PNE2 266 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 GALNT3Q14435 633 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 SLC14A2Q15849 920 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 QPCTQ16769 361 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 ERAP2Q6P179 960 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 TTC27Q6P3X3 843 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 DPPA4Q7L190 304 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RAB11B-201ENST00000328024 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms